FFPE 處理是目前長期保存病理樣本的標準化方法，保存了大量的臨床上患病和正常組織的樣本資源，該樣本代表了珍貴且來源廣泛的生物醫(yī)學研究材料，據(jù)統(tǒng)計世界上大約有數(shù)十億份組織樣品保存在醫(yī)院或者組織樣品庫中，其中大多數(shù)是 FFPE 樣品。但是由于 FFPE 樣本通常珍貴且保存時間長，存在 RNA/DNA 量少和高度降解的問題，因此如何獲得 FFPE 樣本所蘊藏的生物信息，如何利用分子生物學方法對 FFPE 樣本進行檢測，進而針對 FFPE 樣本進行高通量組學分析就變得越來越重要。針對目前熱度很高的空間轉(zhuǎn)錄組學，如何實現(xiàn)對 FFPE 樣本的檢測顯得尤為迫切。
10X Genomics 旗下全新的 Visium FFPE 空間基因表達解決方案，打破過去從 FFPE 組織中獲取空間全轉(zhuǎn)錄組基因表達信息的壁壘 空間轉(zhuǎn)錄組：Visium Spatial Gene Expression 技術不在局限于冰凍組織切片，10XGenomics 通過不懈的研發(fā)整合，已推出 Visium FFPE 空間基因表達解決方案，伯豪生物成為中國首批引進該技術方案的高新技術企業(yè)之一。通過優(yōu)化后空間 Visium FFPE 全轉(zhuǎn)錄組方案，能夠從 FFPE 樣本中以高靈敏度和高特異性分析相關基因的表達，在形態(tài)學背景下實現(xiàn)真正的探索發(fā)現(xiàn)。
Visium FFPE 的原理示意
Visium FFPE 的產(chǎn)品特色
（1）使用已存檔的生物庫樣本進行生物標記物挖掘；
（2）進行回顧性研究和縱向研究，以追蹤特定時間內(nèi)的生物學過程；
（3）通過結(jié)合免疫熒光技術，同時進行蛋白和基因表達可視化檢測；
（4）與 H & E 技術結(jié)合進行形態(tài)學分析，充分挖掘珍貴的組織樣本中的信息；
關于 Visium FFPE
Visium FFPE 組織樣本的可視化空間基因表達是一種突破性的解決方案，它將 FFPE 組織樣本的組織學優(yōu)勢與高通量的 sc-RNA-seq 相結(jié)合，為傳統(tǒng)的病理學分析提供了詳實的補充。該技術可對人類和小鼠 FFPE 樣本中超過 18,000 個基因的 RNA 表達進行高分辨率的空間分析。通過全轉(zhuǎn)錄組分析（WTA）和 FFPE 組織圖譜分析，您可以檢測任何通路中的任何基因，解決組織細胞類群組成的異質(zhì)性，并獲得這些信息在組織樣本中的空間信息。
Visium FFPE 的可視化空間基因表達在完整的 FFPE 組織切片上獲取基因表達信息，可以更深入的了解組織的生理生化特征：包括生物標志物的發(fā)現(xiàn)，對保存的樣本進行回顧性和縱向研究，以及對正常和病變組織的比較研究。
FFPE 組織的可視化空間基因表達具有高敏感性、特異性和可重復性
Visium FFPE 對保存的 FFPE 組織樣本進行了全組織覆蓋的轉(zhuǎn)錄組分析
應用示例：Visium FFPE 空間技術 呈現(xiàn) 三陽性導管癌原位樣本的腫瘤微環(huán)境
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